ブドウ球菌感染症の原因菌は、ミクロコッカス科ブドウ球菌属(Staphylococcus)です。ブドウ球菌は、コアグラーゼの有無により、コアグラーゼ陽性菌と陰性菌に分類されます。27種が知られているブドウ球菌のうち、14種がヒトの皮膚に生息しています。ヒトの病態において、S. aureus(コアグラーゼ陽性)、S. epidermidis(表皮ブドウ球菌)、S. saprophytics(コアグラーゼ陰性)の3種が関与しています。ヒトにおいては、S. aureusが病因となることが最も多く見られます。