第三脳室(ventriculus tertius)は間脳の中央に位置します。脳室腔は矢状方向に位置する狭いスリット状の構造をしており、外側2つ、上側2つ、下側2つ、前側1つ、後側2つの6つの壁によって区切られています。第三脳室の側壁は、互いに向かい合う視床の内側表面と、視床下部溝の下にある視床下領域の内側部分から構成されています。
第三脳室の下壁、すなわち床は視床下部であり、その背面(背側)は脳室腔に面しています。下壁には、第三脳室腔の2つの突起(陥凹)である漏斗陥凹と視神経陥凹(recessus opticus)が区別されます。視神経陥凹は視交叉の前方、視神経交叉の前面と終板(end plate)の間に位置しています。
第三脳室の前壁は、終末板、円蓋柱、および前交連によって形成されます。両側では、前方では円蓋柱、後方では視床前部が脳室間孔(脳室間孔)を限定し、この孔を通して第三脳室の空洞がその側の側脳室と連通します。
第三脳室の後壁は視床上交連で、その下に脳水道の開口部があります。第三脳室の後上部、視床上交連の上には、第三脳室の空洞の別の突起である上脳室陥凹(recessus suprapinealis)があります。第三脳室のすべての壁は、内側、つまり空洞の側面から、脳室上衣で裏打ちされています。上壁は血管基底(tela choroidea)によって形成されます。この基底は柔らかい(血管)膜で表され、脳梁体部後端部と脳弓の下の2つのシート(重複の形態)で間脳の空洞、つまり第三脳室に貫通しています。膜の上部シートは、脳弓の下面と融合します。このシートは脳室間開口部の高さで折り畳まれ、後方に進んで下側のシート、つまり第三脳室の天井部分へと入ります。さらに後方では、この葉は松果体を上から覆い、中脳の上部後面(天井)に位置します。
脳の軟膜の上層と下層、そしてそこにある血管は、血管裂を通って内側から側脳室腔へと入り込んでいます。この血管裂は、視床の上部(背側)表面と脳弓の下面の間にあります。
第三脳室血管基部の上層と下層の間の結合組織には、2本の内大脳静脈(vv. cerebri internae)があります。これらの静脈が合流すると、対になっていない大大脳静脈(v. cerebri magna、ガレノス静脈)を形成します。脳室腔の側面から見ると、第三脳室血管基部は上皮板(第二脳胞の後壁の残骸)で覆われています。血管基部の下層の突起(絨毛)は、それを覆う上皮板とともに第三脳室腔に垂れ下がり、そこで脈絡叢(plexus choroideus)を形成します。脳室間開口部の領域では、この脈絡叢は側脳室の脈絡叢と接続します。
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