他の不安障害と同様に、PTSDの治療成功の鍵は、患者の徹底した精神医学的、身体的、神経学的検査です。なぜなら、治療の選択においては、いくつかの臨床的要因が特に重要となるからです。まず、トラウマを経験した患者は、しばしば身体的または神経学的障害を抱えています。これらの障害には、トラウマの直後に現れるもの(例:器質性脳損傷)もあれば、後になって現れるもの(例:向精神薬乱用患者の離脱症状)もあります。患者はトラウマを何度も経験することがよくあります。したがって、治療計画を立てる際には、トラウマの繰り返しのリスクを評価し、それを回避する対策を講じる必要があります。
HTHD では数多くの薬剤が試験されてきたが、ランダム化比較試験を発表したのはわずか 10 種類ほどである。特定の薬剤が他より優れているという説得力のある証拠はない。しかし、フルオキセチン、フェネルジン、アルプラゾラム、アミトリプチリン、イミプラミン、デシプラミンは中等度の効果があることがわかっている。しかし、HTHD における特定の薬剤の効果については明確な証拠はない。ただし、フルオキセチンは非戦闘外傷の被害者にはより効果的であると報告されており、HTHD の治療薬としておそらく最も研究されているフェネルジンは、過覚醒症状の軽減よりも強迫症状の軽減に効果的である。アルプラゾラムは HTHD の主要な要素である不安を軽減するが、この障害の他の側面にはほとんど効果がない。HTHD における三環系抗うつ薬の試験では、さまざまな結果が得られている。 PTSD に対するこれらの薬の投与計画はパニック障害の場合と同じですが、PTSD 患者の中には、より急速な投与量の増加に十分耐えられる人もいます。
PTSDにおける薬物の有効性に関する研究結果は曖昧であるため、PTSD治療の選択は、主に他の不安障害の治療で検証された原則に基づいています。SSRIは、その安全性、広い治療域、様々な併存疾患に対する高い有効性、そして依存リスクの低さから、PTSD治療における最適な薬剤と考えることができます。同時に、ベンゾジアゼピンの使用は、PTSD患者の多くが向精神薬に依存しているため、主に薬物依存のリスクが高いという重大な問題と関連しています。ベンゾジアゼピンは、激しい不安を迅速に緩和する必要がある場合に最も効果的です。三環系抗うつ薬とMAO阻害薬は、副作用と中毒のリスクを考えると、SSRIが効果がない場合にのみ処方されます。その他の薬剤(ベータ遮断薬、抗てんかん薬、アルファ作動薬)の有効性は、オープン試験でのみ評価されています。これらの薬剤がPTSDの個々の症状を軽減するというエビデンスはあるものの、対照臨床試験の結果が出るまでは慎重に使用する必要があります。社交恐怖症と同様に、PTSDにおける併用療法の有効性は対照臨床試験で評価されていません。しかしながら、社交恐怖症やパニック障害で試験された併用療法(例:ベンゾジアゼピン系薬剤とSSRIまたは三環系抗うつ薬の併用)をPTSDに適用する試みが行われています。