腸管病原性大腸菌症は、徐々に増加する中毒症と吐瀉物中毒、顕著な皮膚の蒼白、まれだが持続する嘔吐(または逆流)、膨張(鼓腸)、少量の透明な粘液が混じった頻繁で多量の水様便、黄色またはオレンジ色の便などに基づき、病気の典型的な形態でのみ疑われます。
主な診断方法は細菌学的検査です。患者の便、場合によっては口腔咽頭粘液、嘔吐物、胃洗浄液、脳脊髄液を検査のために採取します。材料は、おむつまたはトイレから滅菌綿棒で採取します。播種は、従来の栄養培地(エンド培地、レビン培地など)に行います。細菌学的検査での陽性率は50~60%を超えません。発光法では、わずか数時間で大まかな結果を得ることができます。
新生児および生後数ヶ月の乳幼児を対象とした血清学的検査では、原則として陰性の結果となります。生後1年半以降の乳幼児におけるRIGAは、疾患の進行過程における特異的抗体の力価の上昇によってのみ、実用的な意義を持ちます。