臨床像における腸内の腐敗または発酵プロセスの蔓延状況に応じて、腐敗性の消化不良と発酵性の消化不良が通常区別されます。
腐敗性消化不良は、主にタンパク質消化障害、発酵性消化不良(炭水化物)が原因で発生し、腸内微生物叢の性質が重要です。腐敗性消化不良は、中程度の腹部膨張、典型的な悪臭(腐敗臭)を伴う少量のガスの排出、下痢によって現れます。便は濃い色で、腐敗臭がします。腸内での形成と腐敗産物の吸収の結果として、全身中毒の兆候が発生します:脱力感、頭痛、食欲不振、気分の低下、作業能力の低下、血管痙攣を伴う神経循環ジストニア。糞便学的検査では、アンモニアの形成による糞便の急激なアルカリ性反応、顕著な排泄物、保存された横紋筋を伴う筋線維が優勢であることが明らかになります。尿中にインジカンが検出されることがあります。
発酵性消化不良は、顕著な鼓腸、腹部の重苦しさ、ゴロゴロ音、溢れる感じ、実質的に無臭の大量のガスの排出、ガスの排出、カルボレン、駆風茶の摂取、歩行、または骨盤を上げた膝肘の姿勢の後に軽減または消失する発作性の腸疝痛型の腹痛を特徴とします。診断的徴候は、酸っぱい臭いを伴う液状の泡状便が頻繁に排出されることです。便の色は淡黄色で、食べた食物(果物、野菜など)の未消化の残骸が含まれ、便の反応は著しく酸性です。便を顕微鏡で観察すると、細胞外および細胞内に多数のデンプン粒、かなりの量の繊維、有機酸の結晶、およびヨウ素親和性菌叢の代表が明らかになります。
腐敗性および発酵性の消化不良に加えて、多量の下痢、多便、および中性またはアルカリ性反応の軽い「脂肪」便の出現を特徴とする脂肪性消化不良もあります。
糞便検査では、中性脂肪の滴、特に脂肪酸の結晶とその不溶性塩である石鹸(主に腸管型の脂肪便)が多数見つかります。
臨床診療では、腸だけでなく消化管の他の部分も病理学的過程に関与しているため、混合型の消化不良に遭遇することがよくあります。