サザンブロッティング(E. SouthernおよびR. Daviesによって1975年に開発された)は、特定の疾患の遺伝子が同定されている主な方法である。このために、患者の細胞からのDNAを抽出し、制限エンドヌクレアーゼの1つ(またはいくつか)で処理する。得られた断片を電気泳動にかけ、サイズを変えることができる(小さな断片はゲルの細孔を通ってより速く移動する)。次いで、断片をニトロセルロースフィルターに転写(再印刷)し、その上に放射性標識プローブを重ねる。プローブは、相補的な配列にのみ結合する。次いで、オートラジオグラフィーの方法により、電気泳動図上のゲノムDNAの所望の断片の位置が決定される。
標識DNAプローブRNA又はDNA調製物とのハイブリダイゼーション、事前制限および電気泳動することなく、固体マトリックスに与えドリップが(それぞれ、円形または細長い)フィルター上のDNAスポットの構成に応じてドットおよびスロットハイブリダイゼーションと呼ばれます。