カンピロバクター症の臨床診断は非常に困難であり、疫学的データ(動物との接触、病気の集団的性質)を考慮する必要があります。
診断は、造影顕微鏡を用いて糞便塗抹標本中の病原体を同定し、糞便、血液、脳脊髄液、および流産胎児の組織から病原体を分離することで確定されます。播種は、ブリリアントグリーン、チオグリコール酸を含む特別な選択固形栄養培地、または5%の羊または馬の血液と抗生物質を含むトリプチカーゼ大豆ブロスで行います。カンピロバクター症の血清学的研究法は、大規模な疫学研究において重要な役割を果たしますが、散発性症例の診断におけるその価値は比較的小さいです。10~14日間隔で採取したペア血清を検査します。実際には、伝統的な方法(RSK、RPGA)と現代的な方法(ELISA、IB、免疫電気泳動、RLA)の両方が用いられます。抗体価は発症後わずか2週間で最高値に達するため、血清学的方法を用いた早期診断は困難です。
胃腸型カンピロバクター症の鑑別診断は、他の胃腸炎(サルモネラ症、ゾンネ赤痢、ロタウイルス感染症、ノーウォークウイルスおよび関連ウイルスによる胃腸炎、中毒、ブドウ球菌エンテロトキシンへの曝露など)と併せて行う必要があります。脱水症候群を呈する場合は、コレラとの鑑別が必要です。腹痛(中腺炎および腸管の局所的炎症)を呈する場合は、カンピロバクター症を急性虫垂炎および膵炎と鑑別する必要があります。
急性虫垂炎や膵炎を除外するために外科的診察が必要になる場合があります。