黄疸自体、特に直接ビリルビンの増加によって引き起こされる黄疸は、治療の対象にはなりません。むしろ、脂溶性化合物である間接ビリルビンは、脂質含有量の高い神経系の一部の構造に損傷を与える可能性があります。血清中の間接ビリルビン濃度が257~340μmol/lを超えると、この症状が現れることがあります。低アルブミン血症、アシドーシス、そして血液中でアルブミンと結合して競合する複数の薬剤(スルホンアミド、サリチル酸塩)を投与されている未熟児では、ビリルビンは低濃度でも損傷を与えます。黄疸の治療、あるいは黄疸の強度を軽減するための処置は、通常、血清中の非抱合型ビリルビン含有量が高い新生児および幼児(クリグラー・ナジャール症候群など)にのみ行われます。急性ウイルス性肝炎の治療の基本は、食事療法、安静、解毒療法といった基礎療法です。現在、劇症型HBVおよびAGSの場合には、抗ウイルス療法の処方が推奨されています。
肝外胆管閉塞は通常、外科的介入を必要とします。具体的には、胆管から胆石を内視鏡的に除去し、狭窄がある場合はステントやドレナージカテーテルを挿入します。例えば、膵臓(ファーター乳頭部)の腫瘍などにより手術不能な閉塞が生じた場合は、緩和療法として、経肝的または内視鏡的に挿入したステントを用いて胆管からドレナージを行うのが一般的です。現在では、胆管結石患者に対する開腹手術は、内視鏡的乳頭切開術と結石除去に置き換えられています。
肝内胆汁うっ滞(ウイルス性肝炎の胆汁うっ滞型)の場合、ウルソデオキシコール酸製剤が処方され、血漿交換療法が行われます。