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急性気管支炎は、急性呼吸器ウイルス感染症を背景に発症することがよくあります。気管支粘膜の炎症は、RSウイルス感染症、パラインフルエンザ、アデノウイルス感染症、ライノウイルス感染症、インフルエンザでより多く見られます。
近年、非定型病原体であるマイコプラズマ(マイコプラズマ肺炎)やクラミジア(クラミジア・トラコマティス、クラミジア肺炎)感染症(7~30%)による気管支炎の症例数が増加しています。
細菌(インフルエンザ菌、肺炎球菌、連鎖球菌、ブドウ球菌、シュードモナス)の病因的役割を評価することは困難です。なぜなら、小児においては、これらの細菌は呼吸器系の正常微生物叢の日和見菌群だからです。細菌性気管支炎は、異物の誤嚥、食物の習慣的な誤嚥、喉頭狭窄、挿管、気管切開などによる粘膜繊毛クリアランスの著しい障害によって発症することが多くなります。
不利な環境条件、受動喫煙、大気汚染などの要因は確かに重要です。