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チェディアック・東症候群は常染色体劣性遺伝性疾患であり、細胞内タンパク質輸送の障害を基盤としています。1996年にチェディアック・東症候群の遺伝学的性質が解明され、1番染色体長腕(lq42-43)に位置するLYST/CHS1遺伝子の変異が関与していることが示されました。この遺伝子産物は、細胞傷害性細胞のリソソーム、メラノソーム、および分泌顆粒の生合成に関与しています。
CHS遺伝子の変異は、様々な細胞における細胞内顆粒(ガマ)形成の阻害につながる。CHSにおける白血球および線維芽細胞の白血球小体、血小板濃密体、好中球のアズール顆粒、およびメラノサイトのメラノソームは、通常、サイズが著しく大きくなり、形態学的に変化している。これは、合成された物質を貯蔵する細胞小器官の合成経路が単一であることを示唆している。好中球成熟の初期段階では、正常なアズール顆粒が巨大顆粒の大きさに融合するが、後期段階(例えば、骨髄球段階)では、正常サイズの顆粒が形成される場合がある。成熟した好中球には、両方の集団が含まれる。同様の現象が単球でも観察される。
メラノソームによるメラニン生成の阻害は白皮症の発症につながります。メラノサイトではメラノソームのオートファゴサイトーシスが観察されます。
チェディアック・東症候群の患者の約80%は、いわゆる加速期を呈します。これは、様々な臓器への非悪性リンパ腫様浸潤であり、ほとんどの場合、エプスタイン・バーウイルス感染によって引き起こされます。臨床的には、貧血、断続的な出血、重篤でしばしば致死的な感染症が観察されます。感染過程は通常、黄色ブドウ球菌、化膿レンサ球菌、肺炎球菌属によって引き起こされ、皮膚、呼吸器、肺に影響を及ぼすことが最も多いです。加速期は、リンパ球/マクロファージ活性化症候群を伴う他の疾患、特にHLH症候群やグリセリ症候群の加速期と類似しています。
一般的に、加速期および/または重度の感染症は患者の早期死亡につながりますが、文献には成人患者の報告もあります。これらの患者の主な症状は進行性の神経機能障害であり、その多くは末梢神経障害の形で現れますが、その発症機序は依然として不明です。チェディアック・東症候群の患者では、軸索性および脱髄性の末梢神経障害も報告されています。