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PCR法を用いた患者血液中のウイルス粒子の検出は、サイトメガロウイルス感染症の診断および抗ウイルス治療の有効性のモニタリングに用いられます。サイトメガロウイルスに対する抗体を検出する血清学的検査とは異なり、PCR法ではサイトメガロウイルス自体の存在を検出し、血清中のサイトメガロウイルス濃度を定量化することができます。サイトメガロウイルスの検出は、周産期病態の診断において非常に重要です。
サイトメガロウイルスの子宮内感染および周産期感染は深刻な結果をもたらす可能性があります。妊娠中のサイトメガロウイルス感染は、しばしば不顕性感染として現れ、比較的軽度の症状を伴います。このような場合、PCR検査によって疾患の病因を特定することができます。検査材料としては、新生児の尿沈渣細胞、感染女性の子宮頸管粘膜上皮、羊水、眼球結膜および泌尿生殖器の擦過検体、唾液、肝臓穿刺標本などが挙げられます。