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通常、尿道から採取した物質には淋菌は存在しません。
PCRは、淋菌DNAの存在を直接確認し、検査材料中の濃度を定量的に表すことができます。検査材料としては、喀痰、洗浄液、尿、様々な臓器の穿刺標本、嚢胞などが挙げられます。この検査は種特異性と高い感度(95%以上)を誇ります。淋菌感染症のPCR診断は、細菌鏡検および細菌学的検査の結果が陰性であっても、慢性型であっても陽性結果をもたらします。
PCR を用いた材料中の淋菌の検出は、淋菌感染症の診断および治療の効果のモニタリングに使用されます。
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