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個人の表現型特性の多くは、多数の遺伝子によって制御されています。これらの遺伝子はそれぞれ独立して作用します。個人が同じ方向に作用する遺伝子を多数受け継ぐ確率は低いです。環境要因は遺伝子の正規分布に一定の影響を与えます。多くの場合、集団における表現型特性の変動は、一連の遺伝子と環境要因の複合的な作用を反映しています。動脈硬化症、冠動脈疾患、糖尿病、悪性腫瘍、気管支喘息、消化性潰瘍、高血圧症など、多くの一般的な疾患に対する「家系的」素因の存在は古くから知られていますが、それらの遺伝的要素はメンデルの法則に従って遺伝するわけではありません。これらの疾患は、多数の遺伝子と多数の環境要因の相互作用の結果として発症します。このタイプの遺伝は多因子遺伝と呼ばれます。
多因子遺伝性疾患は、常に多遺伝子性要素、すなわち累積的に相互作用する遺伝子配列から構成されます。これらの遺伝子の適切な組み合わせを受け継いだ個人は「リスク閾値」を超え、その時点から、環境要因によって疾患を発症するかどうか、またその重症度が決定されます。
疾患に対する遺伝的素因の多様性は、遺伝的多型性という現象によるものです。集団において複数の変異(対立遺伝子)によって表される遺伝子は、多型性と呼ばれます。同じ遺伝子の対立遺伝子間の差異は、原則として、その遺伝子コードのわずかな差異で構成され、後者は表現型レベル(臨床症状に至るまで)に反映される場合とされない場合があります。特定の対立遺伝子の不利な組み合わせによって、様々な疾患を発症するリスクが高まる可能性があります。これらの関連性は、対立遺伝子多型が遺伝子の機能に影響を与える場合は直接的なものですが、真の「疾患遺伝子」の不利な変異体といずれかの対立遺伝子が連鎖する結果として現れる「マーカー」的な性質を持つ場合もあります。
ヌクレオチド配列の多型性は、エクソン、イントロン、調節領域など、ゲノムのあらゆる構造要素に見られます。遺伝子のコード断片(エクソン)に直接影響を与え、その産物のアミノ酸配列に影響を及ぼす変異は、比較的まれにしか観察されません。多型性の多くは、1つのヌクレオチドの置換、または反復断片の数の変化として発現します。
現時点では、疾患と多因子疾患の特定の遺伝子マーカーとの関係に関するデータは非常に矛盾していることに留意する必要があります。