研究：遺伝子は果物や繊維の抗がん作用に影響する

eBioMedicine誌に掲載された最近の研究では、食物繊維、果物、野菜の摂取と大腸がん（CRC）リスクとの関連を変化させる可能性のある遺伝子変異が特定されました。研究者らは、食物繊維と果物の摂取とCRCリスクとの関連を変化させる重要な遺伝子座を2つ特定することに成功しました。

大腸がん（CRC）は世界で最も一般的ながんの一つであり、2020年には約200万人の新規患者が発生し、90万人以上が死亡しました。果物、野菜、全粒穀物、食物繊維の摂取量が多いと、CRCのリスクが低下することが報告されています。CRCリスクと全粒穀物および食物繊維の摂取量との関連性を示す強力なエビデンスがある一方で、CRCリスクと果物および野菜の摂取量との関連性を示すエビデンスは依然として限られています。

これまでのゲノムワイド関連研究（GWAS）では、大腸がんリスクに関連する遺伝子座が少なくとも200個特定されており、遺伝率の最大35%を説明しています。遺伝子環境（G × E）相互作用はさらなる遺伝率を説明できる可能性がありますが、小規模なサンプルと従来の手法を用いたこれまでの研究では、有意な相互作用は限られた数しか見つかっていません。コンジョイント検定や一塩基多型（SNP）を優先する2段階法などの新しい統計的手法は、これらの解析の精度を向上させる可能性があります。

解析には、ヨーロッパ系住民を含む3つのCRC遺伝子コンソーシアムによる最大45件の研究が含まれました。研究には、コホート研究の症例対照群と、症例対照研究の非がん対照群が含まれていました。果物、野菜、食物繊維の摂取量について、それぞれ69,599人、69,734人、44,890人の参加者が解析されました。食事摂取量は、食品摂取頻度調査票と食事歴を用いて評価し、果物と野菜については1日あたりのサービング数、総食物繊維については1日あたりのグラム数で表しました。

データは調和され、性別と研究ごとに四分位値として表されました。さらに、ジェノタイピングの品質管理には、欠損データ、ハーディ・ワインベルグ平衡、性別不一致のチェック、マイナーアレル頻度と精度のための補完とフィルタリングが含まれ、結果として7,250,911個のSNPが解析されました。

大腸がん患者は対照群と比較して、年齢が高く、BMI（体格指数）とエネルギー摂取量が高く、大腸がんや2型糖尿病の家族歴などのリスク因子の有病率が高かった。また、食物繊維、果物、野菜の摂取量も対照群より少なかった。メタアナリシスでは、食物繊維（四分位増加あたりの相対リスク（OR）= 0.79）、果物（OR = 0.79）、野菜（OR = 0.82）の摂取量と大腸がんリスクの間に逆相関が認められた。

3-DF試験により、SLC26A3遺伝子の上流にrs4730274遺伝子座が同定されました。この遺伝子は食物繊維摂取量との関連、および大腸癌リスクとの相互作用を示します。遺伝子型による層別化では、Tアレルの各コピーにおいて、食物繊維と大腸癌の間に強い逆相関が見られました。機能アノテーションでは、大腸組織においてエンハンサー活性が示唆され、DLD遺伝子のeQTLが認められました。

NEGR1遺伝子近傍のrs1620977遺伝子座は、果物摂取量との有意な関連と、大腸がんリスクとの中程度の相互作用を示した。Gアレルのコピー数が増えるにつれて、果物摂取量の増加と強い逆相関が観察された。

この研究は、これまでで最大規模のG×E研究であり、研究者らは食物繊維、果物摂取、および大腸がんリスクの間に2つの相互作用を特定しました。具体的には、SLC26A3遺伝子付近のrs4730274は、食物繊維摂取、腸管機能、炎症、および大腸がんの間に有意な関連があることを示唆しています。この結果は、臨床的意義を検討し、異なる集団におけるこれらの知見を確認するためのさらなる研究を必要としています。