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集中治療室 (ICU) 患者の鼻腔微生物叢は、敗血症と非敗血症の症例を効果的に区別し、敗血症の予測において腸内微生物叢分析よりも優れていることが、Microbiology Spectrum に掲載された新しい研究で明らかになりました。
「これらの結果は、診断戦略の開発と重篤な病気の治療の進歩に影響を及ぼす」と、中国広東省広州市南方医科大学如江病院臨床検査科マイクロバイオーム医療センターの医学博士、何喬龍教授は述べた。
「これまで、敗血症患者の腸内細菌叢に注目してきましたが、呼吸器系細菌叢にも注目する価値があります。」
敗血症は、死亡率が29.9%から57.5%と高い重篤な疾患です。2016年に敗血症および敗血症性ショックの3番目の国際コンセンサス定義(Sepsis-3)が確立されたにもかかわらず、敗血症の多くの側面は、診断を改善するためにさらなる研究を必要としています。
Sepsis-1からSepsis-3への診断基準の進化は、継続的な研究の必要性を示しています。さらに、敗血症の診断基準は、炎症反応のみに焦点を当てたものから、感染による臓器不全も含めたものへと変化しました。
敗血症の診断は大きく進歩しましたが、感度と特異度の高い生物学的指標は特定されていません。さらに、培養陽性率が低く、培養可能な微生物がほとんど存在しないため、臨床敗血症の診断は制限されます。そのため、敗血症の新しい効果的で信頼性の高いバイオマーカーを特定することが研究者の目標でした。
新しい研究では、研究者は南方医科大学付属病院で男女157人の被験者(89人が敗血症患者)を募集しました。彼らは、ICUと呼吸器および集中治療室の敗血症患者と非敗血症患者から鼻腔スワブと糞便サンプルを収集しました。
研究者は、イルミナの技術を使用してDNAを抽出し、配列を決定しました。バイオインフォマティクス分析、統計処理、機械学習手法を使用して、敗血症患者と非敗血症患者を区別しました。
彼と同僚は、敗血症患者の鼻腔微生物叢は、非敗血症患者と比較して、全体的なコミュニティの豊富さが有意に低く (P=0.002)、構成が異なっていること (P=0.001) を発見しました。敗血症患者の鼻腔微生物叢に豊富に存在する属として、コリネバクテリア、ブドウ球菌、アシネトバクター、シュードモナスが特定されました。
「今後は、抗生物質の効果を超えて敗血症における微生物叢の役割をさらに理解するために、動物モデルやより大規模な患者コホートを使用したさらなる研究の可能性を示唆しています」と、彼は述べました。